Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms