Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc6a4Q60857 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a4Q60857 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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