Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Traf3Q60803 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf3Q60803 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf3Q60803 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms