Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mkrn3Q60764 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms