Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tcf4Q60722 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tcf4Q60722 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tcf4Q60722 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tcf4Q60722 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tcf4Q60722 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tcf4Q60722 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tcf4Q60722 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms