Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SkiQ60698 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms