Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm1Q60636 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms