Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CttnQ60598 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms