Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Xrcc1Q60596 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Xrcc1Q60596 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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