Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SynrgQ5SV85 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynrgQ5SV85 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms