Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ggnbp2Q5SV77 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms