Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sft2d1Q5SSN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms