Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Bhlha9Q5RJB0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms