Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ecm2Q5FW85 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ecm2Q5FW85 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms