Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Znf608Q56A10 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Znf608Q56A10 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Znf608Q56A10 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Znf608Q56A10 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Znf608Q56A10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Znf608Q56A10 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms