Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spire1Q52KF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spire1Q52KF3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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