Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
C2cd3Q52KB6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2cd3Q52KB6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms