Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm4Q4VBF2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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R3hdm4Q4VBF2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
R3hdm4Q4VBF2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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R3hdm4Q4VBF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm4Q4VBF2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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