Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Foxn3Q499D0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxn3Q499D0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxn3Q499D0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxn3Q499D0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxn3Q499D0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms