Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
4930596D02RikQ3V0H9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms