Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp48Q3V0C5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp48Q3V0C5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp48Q3V0C5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp48Q3V0C5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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