Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc9Q3V038 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc9Q3V038 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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