Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms