Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zscan4fQ3URS2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms