Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ceacam12Q3UKP4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ceacam12Q3UKP4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ceacam12Q3UKP4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms