Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gpr55Q3UJF0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms