Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nkx6-3Q3UHX8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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