Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms