Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms