Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U6N9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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