Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q3U595 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U595 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U595 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U595 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U595 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Q3U595 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U595 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U595 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q3U595 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Q3U595 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Q3U595 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Q3U595 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q3U595 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms