Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms