Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms