Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Krt2Q3TTY5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Krt2Q3TTY5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt2Q3TTY5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Krt2Q3TTY5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt2Q3TTY5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms