Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3TTJ4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms