Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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