Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc10Q3TLI0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms