Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms