Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf2f1Q3THK3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms