Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RubcnlQ3TD16 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms