Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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