Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Treml4Q3LRV9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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