Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam178bQ24JP3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Fam178bQ24JP3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Fam178bQ24JP3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam178bQ24JP3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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