Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Shroom4Q1W617 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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