Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cpne9Q1RLL3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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