Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim71Q1PSW8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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