Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ptchd1Q14B62 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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