Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gli2Q0VGT2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms