Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms