Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms